fabio.fabioimage
index
/usr/lib/pymodules/python2.6/fabio/fabioimage.py

Authors: Henning O. Sorensen & Erik Knudsen
         Center for Fundamental Research: Metal Structures in Four Dimensions
         Risoe National Laboratory
         Frederiksborgvej 399
         DK-4000 Roskilde
         email:erik.knudsen@risoe.dk
         
         and Jon Wright, ESRF

 
Modules
       
Image
numpy
bz2
cStringIO
fabio
gzip
math
numpy
os
sys

 
Classes
       
fabioimage

 
class fabioimage
    A common object for images in fable
Contains a numpy array (.data) and dict of meta data (.header)
 
  Methods defined here:
__init__(self, data=None, header=None)
Set up initial values
add(self, other)
Add another Image - warnign, does not clip to 16 bit images by default
getframe(self, num)
returns the file numbered 'num' in the series as a fabioimage
getheader(self)
returns self.header
getmax(self)
Find max value in self.data, caching for the future
getmean(self)
return the mean
getmin(self)
Find min value in self.data, caching for the future
getstddev(self)
return the standard deviation
integrate_area(self, coords)
Sums up a region of interest 
if len(coords) == 4 -> convert coords to slices
if len(coords) == 2 -> use as slices
floor -> ? removed as unused in the function.
make_slice(self, coords)
Convert a len(4) set of coords into a len(2) 
tuple (pair) of slice objects
the latter are immutable, meaning the roi can be cached
next(self)
returns the next file in the series as a fabioimage
previous(self)
returns the previous file in the series as a fabioimage
read(self, filename)
To be overridden - fill in self.header and self.data
readheader(self, filename)
Call the _readheader function...
rebin(self, x_rebin_fact, y_rebin_fact)
Rebin the data and adjust dims
resetvals(self)
Reset cache - call on changing data
toPIL16(self, filename=None)
Convert to Python Imaging Library 16 bit greyscale image
 
FIXME - this should be handled by the libraries now
update_header(self, **kwds)
update the header entries
by default pass in a dict of key, values.
write(self, fname)
To be overwritten - write the file

 
Functions
       
test()
check some basic fabioimage functionality