fabio.fit2dmaskimage
index
/usr/lib/pymodules/python2.6/fabio/fit2dmaskimage.py

Author: Andy Hammersley, ESRF
Translation into python/fabio: Jon Wright, ESRF

 
Modules
       
numpy

 
Classes
       
fabio.fabioimage.fabioimage
fit2dmaskimage

 
class fit2dmaskimage(fabio.fabioimage.fabioimage)
    Read and try to write Andy Hammersley's mask format
 
  Methods defined here:
read(self, fname)
Read in header into self.header and
    the data   into self.data
write(self, fname)
Try to write a file
check we can write zipped also
mimics that fabian was writing uint16 (we sometimes want floats)

Methods inherited from fabio.fabioimage.fabioimage:
__init__(self, data=None, header=None)
Set up initial values
add(self, other)
Add another Image - warnign, does not clip to 16 bit images by default
getframe(self, num)
returns the file numbered 'num' in the series as a fabioimage
getheader(self)
returns self.header
getmax(self)
Find max value in self.data, caching for the future
getmean(self)
return the mean
getmin(self)
Find min value in self.data, caching for the future
getstddev(self)
return the standard deviation
integrate_area(self, coords)
Sums up a region of interest 
if len(coords) == 4 -> convert coords to slices
if len(coords) == 2 -> use as slices
floor -> ? removed as unused in the function.
make_slice(self, coords)
Convert a len(4) set of coords into a len(2) 
tuple (pair) of slice objects
the latter are immutable, meaning the roi can be cached
next(self)
returns the next file in the series as a fabioimage
previous(self)
returns the previous file in the series as a fabioimage
readheader(self, filename)
Call the _readheader function...
rebin(self, x_rebin_fact, y_rebin_fact)
Rebin the data and adjust dims
resetvals(self)
Reset cache - call on changing data
toPIL16(self, filename=None)
Convert to Python Imaging Library 16 bit greyscale image
 
FIXME - this should be handled by the libraries now
update_header(self, **kwds)
update the header entries
by default pass in a dict of key, values.